1.镇静安神，治失眠症。
石菖蒲对某些中枢神经有抑制作用，能镇静安神、催眠，又有芳香化浊、祛痰湿的作用，对治痰热内扰之不寐症有较好的疗效。对于精神病患者亦有镇静和催眠作用。
2.理气活血，治关节疼痛。
石菖蒲味辛，能理气活血，祛风宣湿，用治风湿痹阻、关节疼痛，或跌打损伤之瘀肿疼痛症，临床常用鲜石菖蒲、生姜、栀子等捣碎，敷于疼痛局部，有消肿止痛的作用；若将药捣碎后加适量白酒在锅内炒热后再敷于痛处，效果更佳。
3.醒脾和胃，治湿困脾胃症。
本品含有挥发油，气芳香，能促进消化液分泌及抑制胃肠异常发酵，故能醒脾和胃助运化，用治湿困脾胃症。湿困脾胃，健运失司，则胸闷腹胀，全身困重乏力，纳呆口淡，或胸痞呕恶。临床中，常用石菖蒲、郁金、藿香等配伍。
如连朴饮治湿热中阻，藿香正气散加石菖蒲治湿困脾胃，香砂六君子汤加石菖蒲、佩兰治脾虚湿阻等，均取石菖蒲和中辟浊之功效。
4.豁痰开窍，治癫痫症。
石菖蒲气味芳香，能化湿浊，有宣窍祛痰湿的作用，适用于痰湿蒙蔽、清阳不升而引起的神志不清、耳聋目昏、精神迟钝等。
5.芳香辟浊，预防疾病。
石菖蒲气味芳香，能辟秽化浊，有解毒驱邪之功，是我国古代劳动人民预防疾病的常用药。古人有在端午节用鲜石菖蒲、鲜艾叶挂在门窗上的习俗，作为预防瘟疫之用，皆取石菖蒲芳香辟浊、解毒驱邪的功效。
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